
在現代分子生物學研究領域,核酸定量以及標準品制備是極為關鍵的環節,它們對于確保實驗結果的可靠性與可重復性起著決定性作用。而博清生物科技(南京)有限公司研發生產的熒光定量PCR儀,憑借其卓越的性能,成為了這兩項重要工作的得力工具。
博清生物熒光定量PCR儀實現精準核酸定量
核酸定量在分子生物學實驗里占據著核心地位。無論是PCR反應、基因測序,亦或是其他各類分子生物學實驗,精確知曉樣本中核酸的濃度都是實驗成功的關鍵所在。博清生物科技(南京)有限公司研發生產的熒光定量PCR儀在核酸定量方面,運用了先進的實時熒光定量PCR(qPCR)技術。
其工作原理基于在PCR反應體系中巧妙加入熒光基團。在PCR反應進程中,儀器能夠持續且實時地監測反應體系內熒光信號的動態變化。當熒光信號增強至某一預先設定的閾值時,此時對應的循環次數,即循環閾值Ct(Cycle Threshold,Ct)便會被精準記錄下來。這里存在一個重要的線性關系,即該循環參數Ct與PCR體系中起始模板數的對數之間有著嚴格的對應關系。通過利用不同梯度的陽性定量標準模板進行擴增,獲取相應的Ct值,并將其與陽性定量標準模板數進行對數擬合繪圖,進而構建出標準曲線。最終,依據待測樣品的Ct值,借助這條標準曲線,就能極為準確地確定起始模板的數量。
與傳統的核酸定量方法相比,博清生物科技(南京)有限公司研發生產的熒光定量PCR儀優勢顯著。以常見的紫外-可見分光光度法為例,雖然該方法操作簡單、速度快,但其嚴重缺陷在于無法有效區分DNA與RNA,并且對樣本中的雜質較為敏感,容易導致定量結果不準確。而博清生物熒光定量PCR儀不僅能夠精準區分DNA和RNA,還具備極高的靈敏度,能夠檢測出極低濃度的核酸樣本,即便是單拷貝的DNA或RNA也能有效檢測。同時,其特異性也非常出色,使用特異性探針(如TaqMan探針)時,能夠精確區分特定基因的突變和變異,這是傳統方法難以企及的。
在實際應用場景中,比如在基因表達分析方面,科研人員通過博清生物科技(南京)有限公司研發生產的熒光定量PCR儀定量檢測不同條件下基因的表達水平,進而深入研究基因的調控機制,探究基因在響應特定刺激時的表達變化情況,以及分析基因在不同組織或發育階段的差異表達。在病原體檢測領域,由于該儀器的高靈敏度,能夠快速、準確地檢測樣本中極低含量的病毒、細菌或其他病原體,像新冠病毒、流感病毒、結核分枝桿菌等的檢測,為疾病的早期診斷和防控提供了有力支持。
博清生物熒光定量PCR儀助力標準品制備
標準品的制備在熒光定量PCR實驗中至關重要,它直接關系到實驗數據的準確性和可靠性。博清生物科技(南京)有限公司研發生產的熒光定量PCR儀在標準品制備方面,為科研人員提供了多種行之有效的方法。
DNA標準品制備
PCR擴增片段作為標準品
通過常規PCR技術對目的靶點進行擴增,隨后對擴增得到的片段進行回收和純化處理,這些純化后的PCR擴增片段便可直接作為標準品使用。這種方法的優勢在于操作相對簡便,易于生成標準品。然而,其不足之處在于穩定性相對欠佳,相較于質粒,PCR擴增片段在儲存過程中可能更容易發生降解等變化,從而影響標準品的長期使用效果。
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具體操作流程為,先將目的片段進行PCR擴增,接著回收目的條帶,并將其連接到T載體上。完成連接后,進行質粒提取操作,通過OD值定量確定質粒濃度,最后將質粒進行梯度稀釋,便可作為標準品用于實驗。質粒克隆作為標準品的優點十分突出,它易于生成和定量,并且在適當的儲存條件下,能夠較好地維持穩定性,為實驗提供可靠的標準參照。不過,該方法也存在一定的局限性,在用于qRT-PCR實驗時,由于無法模擬逆轉錄步驟,可能會在一定程度上影響反應效率。
RNA標準品制備
主要通過制備目的靶點的體外轉錄RNA來作為標準品。其制備過程相對復雜,首先利用實時熒光定量PCR生成的PCR產物,借助包含5’T7啟動子的序列和包含3’poly(T)的逆轉錄引物重新進行擴增。隨后進行體外轉錄反應,生成多聚腺苷酸化正義mRNA。對轉錄得到的mRNA進行純化處理后,將其準確定量并進行稀釋,最終用于生成標準曲線。這種RNA標準品的優勢在于能夠結合RT效率,最大程度地模擬目的靶點在實際反應中的狀態。但不可避免的是,該方法需要耗費大量的時間和精力來生成標準品,并且由于RNA本身的不穩定性,使得其難以長期保持高度的準確性,對儲存條件和使用期限都有較為嚴格的要求。
在制備標準品時,需要嚴格遵循一系列注意事項,以確保標準品的質量。模板的選擇和處理至關重要,要盡可能保證模板的純度,避免其受到污染或降解。引物的設計應遵循嚴格的原則,引物長度一般以15-30個堿基為宜,上下游引物的長度差別不宜大于3個堿基。引物的(G+C)含量應控制在40%-60%,且4種堿基在引物中應均勻分配。引物自身不能存在互補序列,尤其不能有大于3bp的反向重復序列,否則容易形成發夾結構,影響引物與模板的結合。上下游引物之間也不應有過多的互補或同源堿基,特別是要避免3’端的互補重疊,以防形成引物二聚體。引物的3’端不能進行任何修飾,且不能有形成二級結構的可能性,3’端堿基盡量避免選用T。而引物的5’端則可以根據實驗需求進行適當修飾。同時,還需通過預實驗確定引物的最適濃度,一般濃度范圍在0.2-1.0μmol/l。
博清生物科技(南京)有限公司研發生產的熒光定量PCR儀在分子生物學的核酸定量與標準品制備工作中展現出了強大的功能和顯著的優勢。它為科研人員提供了精準、可靠的實驗手段,有力地推動了分子生物學領域的研究進展,在基因表達分析、病原體檢測、基因突變檢測等眾多研究方向上都發揮著不可或缺的重要作用,成為現代分子生物學實驗室的必備儀器之一。
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